GTF发动机的问题目前正在影响吉祥航空的发展。根据一份监管文件显示，虽然中国航空市场整体呈增长趋势，但吉祥航空在2025年8月的可用座位公里数（ASK）同比下降了2.7%。中国航空机队数据显示，吉祥航空现有103架飞机，包括30架A320-200、22架A320-200N、27架A321-200s、14架A321-200NX和10架B787-9。当前，这些飞机里有20架处于停飞状态，具体为9架A320-200N、2架A321-200s和9架A321-200NX。

吉祥航空拥有36架搭载PW1100G发动机的A320neo系列飞机，是中国第三大使用该款发动机的航司，仅排在四川航空（64架GTF动力飞机）和中国国际航空（53架GTF动力飞机）之后。在2024年8月27日的财报会上，董事长王均金证实，GTF发动机的维修问题导致公司部分飞机停飞，这对飞机的利用率产生了较大负面影响。

吉祥航空还拥有一家低成本子公司——广州九元航空，该公司运营着5架B737-8和22架B737-800。